Es el complemento de un trabajo de limpieza y consiste en eliminar todo tipo de microorganismos. Una limpieza profunda permite acabar con la suciedad. Sin embargo, la sanitización acaba con los microorganismos que la misma, no es capaz de eliminar. En el mercado existen muchos productos diferentes capaces de sanitizar. Sin embargo, cada uno presenta un serie de ventajas y desventajas que les hace estar más indicados para luchar contra cierto tipo de microorganismos que otros.